想要保证实验室冻干机使用的效果，选购合适的设备也很重要，设备的面积大小选择也可以说成容量大小的选择。实验室冻干机容量应根据企业生产的规模或实验的需要来选择。用户应根据自己的生产量来决定需要选择哪种类型的实验室冻干机，可通过计算来确定某些数据。
使用盘装法和瓶装法的面积不一定相同。盘装法充分利用了板层的面积，而瓶装法由于瓶之间的间隙未充分利用，所需的板层面积较大。
如果使用盘装法，每盘的装载高度为20mm，则200kg（L）的液体所需的板层面积为：
A（面积，m2）=V（容积，m3）/H(高度，m)；
即需选用的板层面积为10m2的实验室冻干机，再查一下10m2的实验室冻干机的冷凝器的结冰量是否能承受200kg(L)的能力，如果满足要求，就可以选用该种型号的实验室冻干机。
如果使用瓶装法，使用的瓶子为国产的青霉素瓶，每瓶内的装量为5ml。
首先要计算每批所需的瓶子总量：
N(瓶子数目)=V(总装量ml)/V(每瓶的装量ml)；
然后计算冻箱的板层面积：A（面积m2）=a(每瓶占用面积m2)*N（总瓶数）。
由于圆瓶子之间互相错开挤齐，因此实际占用面积可减少，大致可乘上一个系数0.9。
再查一下设备的冷凝器结冰量是否符合要求，如果符合即可选定。
有时计算的面积与实际型号的面积不*相同，那未可选择接近的型号。冻干箱板层间距离同样根据盘装或瓶装不同来确定。盘子的高度一般为40-50mm，再加上50mm的空隙，可选为100mm瓶装则需根据瓶高来确定，大致为瓶子高度加30mm的空隙。
有时实验室冻干机需要在不同时间使用不同高度的容器，则可以选用板层距离可调型的设备。这种设备可以很方便地把二层板层合并为一层，使板层的距离比原来增大一倍。
