冻干机发展至今，其种类也逐渐增多。按其功能划分，可分为：普通型冻干机、压盖型冻干机、多歧管普通型冻干机、多歧管压盖型冻干机、T型架冻干机、原位型冻干机。
①普通型冻干机：适合大多数常规实验，物料可散装于物料盘内进行冷冻干燥；
②压盖型冻干机：自带压盖装置，物料可散装于物料盘进行干燥，也可针对西林瓶装物料的干燥，干燥结束后手动操作压盖装置压紧瓶盖，使西林瓶样品在真空环境下进行密封，避免二次污染、重新吸附水分；
③多歧管普通型冻干机：干燥室外部连接8个烧瓶，烧瓶各自连接干燥室，也可通过对应开关控制单独切断相应烧瓶与干燥室的连接，可按需要随时取下或装上烧瓶，不需要停机。干燥室内可以进行常规药品冻干，烧瓶内也可以物料干燥实验，适合观察物料在不同干燥时间下的变化情况，便于研究实验室课堂的授课；
④多歧管压盖型冻干机：干燥室外部连接8个烧瓶，且自带压盖装置。既适合常规样品干燥、以及使用烧瓶干燥研究物料变化过程，又可以针对西林瓶装物料进行干燥并在真空下直接进行压塞密封操作；
⑤T型架冻干机：适用于安瓿管、安瓿瓶装物料干燥。对细菌，真菌等微生物菌种的保藏，实验室常采用安瓿封存法。样品冷冻干燥后封装在小安瓿内。它具有保藏期长、变异小，便于大量保藏及适用范围较广等优点。便于实验室、科研的样品干燥实验，冻干过程可拆卸观察；
⑥原位型冻干机：原位预冻、原位干燥。它改变了传统冻干机干燥过程的人工繁琐操作，防止了物料的污染，实现了干燥升华的自动化。
